首先，必须对拟处理污水水质进行检测，如水的PH值、水中是否有抑制菌种生长的物质？常规的菌种适合的PH值为6~9，污水中含油、盐等物质会抑制菌种的生长，必须进行预处理进行控制。
其次，投加的菌种必须适合该污水，也就是说，该菌种能分解水中的污染物。
第三，必须做好详细的投加方案，运行状态的投加与调试状态的投加方法是原全不同的，投加菌种必须达到优势菌种才能达到理想的效果。
第四，投加后必须控制进水水量、溶解氧等参数。
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